标签： bioinformatics blast ncbi
我有本地数据库驱动的网站，其中包含一些通过其GI编号唯一识别的序列。是否可以直接链接到“NCBI爆炸现场”给出GI。例如，GI 903049的序列具有以下链接：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/903049
它链接到这个爆炸页面：
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&QUERY=U22848.1&DATABASE=nr&MEGABLAST=on&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&LINK_LOC=nuccore&PAGE_TYPE=BlastSearch
我想直接链接到这个网站，而不必去NCBI。感谢。
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您可以使用ncbi efetch下载所有gis：
http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=nuccore&id=903049&rettype=fasta&retmode=text
并运行本地版本的blast：http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=Download
你也可以问Biostar：http://www.biostars.org/show/questions/