BLAST数据库错误:在搜索路径中找不到核苷酸数据库[swissprot]的别名或索引文件

时间:2015-11-21 12:14:08

标签: perl blast

我关注此链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK52637/

我安装了NCBI BLAST +包。然后在blast-2.2.31 +文件夹中创建db文件夹以下载NCBI数据库之一。我选择swissprot数据库并将其下载到db文件夹中。之后,我跑:

perl update_blastdb.pl --passive swissprot

并成功连接到NCBI并在bin文件夹中下载swissport。所以,现在我有两个swissprot.tar.gz。一个我在db文件夹中下载它,一个在运行perl cammand后下载到bin文件夹中。

然后我设置PATH和BLASTDB环境变量。 BLASTDB将包含哪个swissport数据库? db或bin中的那个?

我输入时会出现主要问题: blastdbcmd -db swissprot -info

BLAST数据库错误:在搜索路径中找不到核苷酸数据库[swissprot]的别名或索引文件.....

这意味着什么? 我一步一步地按照链接。

任何提示?

谢谢你和问候,,, 阿拉

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