标签： algorithm dynamic-programming approximation lcs
在最长公共子序列问题中，我们有两个字符串s1和s2，其长度为m和n，我们希望找到s1和s2中最长的子序列，这些子序列不需要占用原始序列中的连续位置。问题的常见解决方案是使用动态编程，这需要O（mn）时间复杂度，但我想要基因组子序列中的LCS的近似值，其由A，C，G，T作为字母表组成，我搜索了很多关于此的信息。 ，我只找到一些O（mn log log n / log ^ 2 n）时间的近似值。我发现的最佳近似值是here，它是LCS的并行版本，不适合我。