如何规范我有关微阵列和RNA-seq的表达数据列?

时间:2019-02-05 11:34:04

标签: r expression normalization boxplot rna-seq

我已经下载了微阵列的表达数据矩阵文件。 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE75nnn/GSE75433/matrix/GSE75433_series_matrix.txt.gz 它是对数数据。 但是,当我绘制该矩阵的箱线图时,大多数数据都在第一季度。 它是归一化的数据吗? 我该如何解决?

data<- read.delim("GSE75433_series_matrix.txt", comment.char="!")
boxplot(data[,-1])

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