在R中使用BLAST SRA功能

Question

我是R菜鸟，但是我可以从R中的命令行控制NCBI BLAST中的SRA功能吗？众所周知，NCBI网站不可靠，我希望能够管理批量文件。

Answer 1

ape和BoSSA包在一起应该做你想要的。 BoSSA具有一个blast函数，可以调用blast API并使用来自ape的DNAbin格式。