标签: blast
我知道BLAST(基本的局部对齐搜索工具)是为什么设计的。但我有兴趣使用这种高级文本比较及其最终效果。
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您可以使用vmatch。
如果你想使用工具进行子串的局部对齐,你可能想要使用STELLAR,纸张:http://www.biomedcentral.com/1471-2105/12/S9/S15/
它可以完成爆炸所做的一切,但是使用字符非常方便。