如何将库添加到pymol？

Question

我已经在我的Mac上下载并使用了pymol。我从应用程序文件夹中打开它。我可以在其中成功运行python脚本。但是，我无法在该脚本中导入任何库。我目前知道的将可导入库添加到python环境的方法是通过anaconda导航器。有没有办法让anaconda将pymol应用程序视为可以添加库的环境？

有没有更简单的方法来添加库？我尝试使用pip install，但是我不太了解，而且我一直无法找到将ipip install插入pymol环境的方法。

对不起，如果这个问题的答案很简单，那么我是编程新手。

Answer 1

• PyMol安装程序将安装自己的Python3。
• 要在系统蟒蛇上安装PyMOL，请使用conda install -c schrodinger pymol。
• 要在安装python3-dev libglm-dev freeglut3-dev libglew-dev libpng12-dev libfreetype6-dev build-essential libxml++3.6-dev之后不使用Anaconda you have to compile it进行安装，这是非常困难的。
• 从系统/ conda python（例如在Mac ln -s /Applications/PyMOL.app/Contents/lib/python3.7/site-packages/pymol /Users/myname/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/pymol上）为pymol，egg文件和Schrödinger制作的依赖项apbs {{1}建立符号链接} freemol glew mengine mpeg_encode mtz2ccp4_px pdb2pqr并指点非Schrödingerpmw或类似的技巧似乎无效对于任何人-许多人都尝试过。

因此，如果您想在PyMOL中使用脚本并安装库，只需在PyMOL中调用python，在Mac上说libopenblas。在Linux上，您可能安装了/Applications/PyMOL.app/Contents/bin/python3.7最终都不会以1.8结尾，因此这并不适用。在Windows上，您将必须找到它的安装位置（PyMOL中的conda install -c schrodinger pymol和import sys）。

因此，如果您想在Python代码print sys.executable中使用PyMOL或将其编译为pip。是的，这很浪费，您必须重新添加许可证。
关于此模式，请记住在不显示conda install -c schrodinger pymol或pymol_argv = ['pymol', '-qc']的情况下运行。