我正在使用从PDB下载的5IVW。这有5个亚基;每个残基都有自己的残基编号-如果我对1-100个残基进行着色,则会对5组残基进行着色。如果我用鼠标选择原子,我会看到该亚基的标识: 5IVW / B / ...;即我已经选择了亚基B中的原子,但是如何通过其内部名称选择亚基或pymol中的任何东西-这样我就可以为亚基B中的残基着色?该文档提供了有关按原子,元素,残基等进行选择的广泛信息。
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在5IVW的“大分子”部分中进行查看。这里, 结构中的六个链(或子单元)分别命名为 V , W , 0 , 1 , 2 和 3 。 因此,用于选择“ subunit2”的语法应为:
select subunit2, chain W
请注意,在/ 5ivw / B 中,B代表segi-identifier,而不是链或亚基。