如何仅对PyMOL中的骨架氮原子进行着色？

Question

我有一个结构的卡通插图。在此结构上，我想显示主链氮的颜色。我尝试过

选择bb，名称为n 然后尝试通过表示和元素为bb上色

但是，不幸的是，所有这些选项似乎都没有给出颜色。您能不能让我知道如何仅对骨架氮进行着色？

谢谢

Answer 1

蛋白质内部的卡通形象是每个氨基酸中三个原子的平均值：Cα和酰胺键的C和N原子。我不确定如果只将该表示形式的“ N部分”涂上颜色，您会如何看待它。

请注意：卡通的颜色是由C alpha决定的，因此为N着色将无济于事，但是，如果为C alpha（名称CA）着色，则会为 full 卡通着色

如果您想要一个具有多种颜色的螺旋线，则应该看一下 spectrum允许卡通的交替颜色。也许您可以将一些东西摆弄在一起。

例如一个9mer肽在每个氨基酸上都将具有红白色和蓝色交替，如下所示：

spectrum count, red white blue red white blue red white blue red white blue red white blue red white blue red white blue red white blue red white blue, 9merselection