合并Affymetrix和ENTREZ基因注释

时间:2018-12-20 09:53:16

标签: r biomart

我们正在使用Connectivitymap数据库(www.clue.io)。在此网站上,您可以下载不同实验的基因表达(其他选项)。

问题在于,对于一​​个实验,该基因用affymetrix参考进行注释,而在另一个实验中,使用ENTREZ和HUGO名称进行注释。我们在合并这两个不同的注释时遇到了问题。

我们试图使用biomart R软件包解决此问题。

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