如何将Affymetrix探针ID映射到基因符号?

时间:2017-05-22 15:23:16

标签: r bioinformatics bioconductor

我有一个ExpressionSet,combArr.eset,它包含Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array基因表达数据。我还有一个矩阵exprs_combArr.eset,它包含combArr.eset的表达式数据。 exprs_combArr.eset的行名是hgu133plus2探测ID,列名是Gene Expression Omnibus样本ID。

我想将exprs_combArr.eset中的探测ID更改为相应的基因符号,但我不知道该怎么做。

我从hgu122plus2.db包中检索了hgu133plus2SYMBOL对象,该对象包含制造商标识符和基因缩写之间的映射,但我不知道如何使用它来更改exprs_combArr.eset中的探测ID。

我是R和Bioconductor的新手,以及一般的编程,所以任何帮助都会受到赞赏。 谢谢!

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