从基因符号和ID获取基因位置

Question

我想从基因符号（例如：TTN）和基因ID（例如：ENSG00000155657）获得人类基因组的基因定位。我想用R的biomaRt包来做这个。我怎么能这样做？

Answer 1

我不完全确定您的基因位置是什么意思，但我认为以下内容应该让您开始：

values

您可以通过向listAttributes(ensembl)列表添加其他向量（在此示例中为长度为2）来输入更多过滤器。

您可以使用函数{{1}}来获取包含您可以从biomart获取的所有属性的data.frame。

正如@neilfws已经说过，biomaRt user guide是寻找有关biomaRt的更多信息的正确位置。我建议您在Bioconductor support forum上询问有关生物传感器R包装的更多问题，例如biomaRt。