将环境数据添加到R中的CCA排序

Question

我正在使用Phyloseq / vegan包将环境数据添加到我的圣职任命中。在完成排序后，输出告诉我：

Some constraints were aliased because they were collinear (redundant)

当我更改环境数据列的公式中的顺序时，只有前7个被认为是不受约束的。这可能是因为我所拥有的环境数据数量缺乏样本吗？我不确定我的下一步应该是什么。任何帮助都会很棒！

Answer 1

您的环境变量完全相关。您的一个或多个约束变量可以与其他变量准确表达，并且没有新信息。变量的顺序将决定哪些变量对第一个变量是多余的。它是关于你的约束，而不是关于观察的数量。

以下示例：在纯素 dune.env数据中，自然管理（Management级别NM）未受精（Manure级{ {1}}）。如果您知道0级别为Management，则表示NM 必须为Manure，因此有关0的信息是多余的，多余的，不需要的，它是别名的。如果更改了变量的顺序，则Manure的某个级别（最后一个）会出现别名。所以它是关于约束的结构，除了新的实验设计之外你无法帮助它。