CCA输出问题

Question

非常感谢帮助！

我已经完成了一个CCA图，显示了7个站点，大约15种和6个环境变量。但是，它表示无约束轴为0，我无法在CCA结果上完成ANOVA，以便了解轴的重要性。我还尝试使用spenvcor函数来查看环境与物种的相关性，它给出了所有轴的1。

所以我肯定做错了什么，但我无法弄清楚是什么。 这是我的代码：

MayEnviro <- read.csv("MayEnviro.csv", header=TRUE)
MaySpecies <- read.csv("MaySpecies.csv", header=TRUE)
t <- cca(MaySpecies,
         MayEnviro[, c("AFDM","Chla","Chloride","TSS","TN","TP","Velocity")])
spenvcor(t)   

Answer 1

从 n = 7个站点， m = 15种物种的数据集中可以得出的轴数是min(n, m) - 1，即6。您还有6个约束（环境变量），您可以准确地解释数据，并且没有剩余的差异可供使用。事实上，解决方案没有任何限制，结果就像CA一样。

在这种情况下，由于网站数量太少，您应该选择适合具有较少约束的模型，例如最多2或3个。