在二级MATLAB的pca上设计新点

Question

我正在尝试使用PCA来可视化我的k-means算法的实现。我正在遵循this link中关于主成分系数，分数和方差的教程。

我使用以下命令：[coeff,score,~]=pca(X');其中X是我的数据。

我的数据是30 x 455矩阵，即30个特征，包含455个样本。我已成功使用score参数创建2D图以用于可视化目的。现在我希望将30维中心投射到那个平原上。我试过coeff*centers(:,1)，但我不明白这是否正确用法。

如何将新的30维点投影到第一个与第二个pca组件的2D？

Answer 1

我假设centers(:, 1)你表示一个新观察。要在主要组件中表达这种观察，你应该写

[coeff, score, ~, ~, ~, mu]=pca(X');   %return the estimated mean "mu"
tmp = centers(:, 1) - mu';   %remove mean since pca() by default centers data
coeff' * tmp;   % the new observation expressed in the principal components

请注意，您必须减去均值，因为默认情况下pca()将数据居中。另外，请注意coeff上的转置'。实际上它应该是inv(coeff)，但由于coeff是orthogonal matrix，我们可以使用转置。