为微阵列数据运行ComBat时出错

时间:2017-04-18 06:32:55

标签: r

我实际上是一名分子生物学家,很少或根本不知道编码。我只是按照在线说明运行ComBat来规范化我的微阵列样品中的批量效应,我在3年内分4次运行,我相信会有批次效应。 我准备了样本表达式和信息文件并在R中运行它。但是在某一点上我得到以下错误:

ComBat('Expressiondata.txt','Information.txt')
Reading Sample Information File
Reading Expression Data File
Found 4 batches
Found 1 covariate(s)
Standardizing Data across genes
Fitting L/S model and finding priors
Finding parametric adjustments
Adjusting the Data
Error in data.frame(..., check.names = FALSE) : 
  arguments imply differing number of rows: 0, 47314

如果有任何帮助,我将不胜感激。

感谢。

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