Question

只是一点背景知识：

我创建了一个斐济（只是ImageJ）宏，它采用扫描图像的文件夹（6mm板以3 * 4方式对齐）识别这些ROI（板）并将它们分成单独的图像。然后比较这些单个图像以进行差异图像分析，并将结果存储为excel电子表格。这个目的是在一天结束时激活，并在一夜之间处理。

我的问题是，斐济的记忆慢慢填满然后抛出一个错误，停止了程序。我的代码中有垃圾收集，但它从来没有完全清除内存，这就是为什么慢慢填充容量。

我真的希望这可以在大多数机器上工作（因此购买更多内存不是真正的选择）我在目前的测试机上有8GB的RAM和分配给FIJI的3/4。

以下是我认为问题所在的代码。（这是比较各个图像的宏的最后一步）非常感谢任何帮助：）

function jakero(startdir, enddir){

    path = getFileList(startdir);
    for(i=0; i<path.length; i++){
        open(startdir+path[i]);
        print(path[i]);
        if(i%2){        
            run("Images to Stack", "name=stack1 title=[] use");
            wait(1000);
            //create the image difference between the sequential scans
            selectWindow("stack1");
            run("Image Stabilizer", "transformation=Affine maximum_pyramid_levels=4 template_update_coefficient=0.90 maximum_iterations=20000 error_tolerance=0.0000001");
            run("Collect Garbage");
            run("Z Project...", "start=1 stop=2 projection=[Max Intensity]");
            imageCalculator("Difference create", "stack1","MAX_stack1");
            selectWindow("MAX_stack1");
            wait(2000);
            run("Close");
            run("Collect Garbage");
            wait(100);
            selectWindow("Result of stack1");
            wait(2000);
            run("Gaussian Blur...", "sigma=2 stack");
            wait(2000);
            //for tif was 5000 3500
            run("Hysteresis...", "high=30 low=10");
            wait(8000);
            selectWindow("Result of stack1");
            wait(100);
            run("Close");
            wait(100);
            selectWindow("Hysteresis");
            wait(100);
            rename("Result of stack1");
            wait(100);
            run("Invert");
            wait(2000);
            run("Properties...", "channels=1 slices=1 frames=1 unit=mm pixel_width=0.0105834 pixel_height=0.0105834 voxel_depth=25.4000508 frame=[0 sec] origin=0,0");
            wait(2000);
            run("Analyze Particles...", "size=0.005-0.8 circularity=0.08-0.8 show=Nothing display exclude clear add");
            selectWindow("stack1");
            run("Select All");
            roiManager("Combine");

            //saveAs("Tiff", enddir);   
            selectWindow("Result of stack1");
            close();
            run("Collect Garbage");
            close();
            run("Collect Garbage");
            fileName = split(path[i-1],".");
            saveAs("Results", ""+enddir+""+fileName[0]+".xls");
            k=1;
            for (k=1; k<=5; k++) {
                run("Collect Garbage");
                call("CollectGarbage_.registerCloseListener");
            };

        }
    }
}

斐济（只是ImageJ）记忆问题

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