没有排序和树状图的热图

时间:2013-09-22 11:15:07

标签: r heatmap

我有一个包含2列和100万行的文件!我只想在没有任何排序的情况下绘制它们,因为我订购了数据。如何在没有任何树形图和重新排序的情况下使用heatmap.2制作热图?

当我使用

heatmap.2(x, dendrogram="none")

Error: cannot allocate vector of size 4660.6 Gb

但是

我试过没有"Rowv"

heatmap.2(x, Rowv=FALSE) 

Warning message:
In heatmap.2(x, Rowv = FALSE) :
  Discrepancy: Rowv is FALSE, while dendrogram is `column'. Omitting row dendogram.

1 个答案:

答案 0 :(得分:10)

我认为你在那里有两个论点,你只需将它们放在一起。

# Generate some sample data.
n<-1e6*2
m<-matrix(rnorm(n),ncol=2)
# Plot heatmap without reordering or dendrogram.
heatmap.2(m,dendrogram='none', Rowv=FALSE, Colv=FALSE,trace='none')

enter image description here

很难想象这样绘制如此多的数据是否有用,但也许你有一些想法。