我有BLAST的XML输出文件，如何在PDB数据库中找到匹配项？

Question

我有一个blast输出XML文件，我想找到一种通过RSCB蛋白质数据库运行文件内容的方法，以便在我的输出文件和使用Python的PDB中的任何内容之间找到某种同源性。

我仍然对这一切都很陌生，并且为了开始这个而感到难过。提前谢谢！

Answer 1

您能举例说明BLAST输出吗？

你已经看过这个页了吗？

http://www.rcsb.org/pdb/software/static.do?p=/software/webservices/search_nmr.jsp

它可以帮助您开始使用他们的API。