我有一个关于爆炸的安装,并使用本地微生物数据库来运行BLAST搜索。 “blastn”工作

时间:2012-06-07 22:04:37

标签: blast

我已经在我的Linux机器上安装了BLAST +以及微生物数据库的本地副本。 “blastn”适用于像

这样的查询
blastn -query query.txt -db 16SMicrobial 

然而,blastp失败,例如

blastp -query query_protein.txt -db 16SMicrobial

给出

  

BLAST数据库错误:找不到蛋白质的别名或索引文件   数据库[16SMicrobial]在搜索路径[.... / databases]

我的数据库目录包含这些文件 -

  16SMicrobial.nhr 16SMmicrobial。and 16SMicrobial.nog 16SMicrobial.nsi   16SMicrobial.nin 16SMicrobial.nni 16SMicrobial.nsd 16SMicrobial.nsq

我的.ncbirc文件有

[NCBI]
DATA=.../databases

[BLAST]
BLASTDB=.../databases

对于可能出现的问题,请知道吗?

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