我已经在我的Linux机器上安装了BLAST +以及微生物数据库的本地副本。 “blastn”适用于像
这样的查询blastn -query query.txt -db 16SMicrobial
然而,blastp失败,例如
blastp -query query_protein.txt -db 16SMicrobial
给出
BLAST数据库错误:找不到蛋白质的别名或索引文件 数据库[16SMicrobial]在搜索路径[.... / databases]
我的数据库目录包含这些文件 -
16SMicrobial.nhr 16SMmicrobial。and 16SMicrobial.nog 16SMicrobial.nsi 16SMicrobial.nin 16SMicrobial.nni 16SMicrobial.nsd 16SMicrobial.nsq
我的.ncbirc
文件有
[NCBI]
DATA=.../databases
[BLAST]
BLASTDB=.../databases
对于可能出现的问题,请知道吗?