Question

我正忙着探索R的包 vegan ，用它来计算社区矩阵和空模型的嵌套性。我对使用permat函数以及Oecosimu特别感兴趣。

然而，在运行我的程序时，我获得了以下错误：

nullmodel（comm，method）出错：找不到函数“list2env” nullmodel（m，ALGO）出错：找不到函数“list2env”

然后，我甚至运行了一个如何使用R帮助函数给出的这些函数的示例（如下所示），甚至这些示例也给出了相同的错误。我想为了使用这些功能而导入其他东西，或者我该如何解决这个问题呢？

示例：

m <- matrix(c(
   1,3,2,0,3,1,
   0,2,1,0,2,1,
   0,0,1,2,0,3,
   0,0,0,1,4,3
   ), 4, 6, byrow=TRUE)

x1 <- permatswap(m, "quasiswap")

summary(x1)

x2 <- permatfull(m)

summary(x2)

x3 <- permatfull(m, "none", mtype="prab")

x3$orig  

summary(x3)

x4 <- permatfull(m, strata=c(1,1,2,2))

summary(x4)

Answer 1

从技术上讲，这是R-Forge上Vegan的开发版本中的一个错误。我们未能在DESCRIPTION中声明对R版本＆gt; = 2.12的依赖。我已经检查了源代码树的相关更改以解决此问题，但是在R-Forge重建tarball和二进制文件之前需要一天左右。

那就是说，您应该将R更新为更近期的内容。或者使用CRAN上的Vegan 2.0-x中提供的那些功能的版本。

Answer 2

list2env是R base的一部分，这意味着它附带了发行版，而不是附加软件包。因此，如果您没有它，您可能要么运行旧版本的R，要么安装中断。这个例子对我很好，R 2.12.1和素食主义者2.1-0。

Answer 3

您的代码适用于我而没有错误消息

您错误的最可能原因是您使用旧版R，vegan或permute

R news for changes说

版本变更2.12.0：新功能：

o New list2env() utility function as an inverse of
  as.list(<environment>) and for fast multi-assign() to existing
  environment.  as.environment() is now generic and uses list2env()
  as list method.

R版本的变化2.12.1：BUG FIXES：

o When list2env() created an environment it was missing a PROTECT
  call and so was vulnerable to garbage collection.

版本2.13.0中的变化：新功能：

o list2env(envir = NULL) defaults to hashing (with a suitably sized
  environment) for lists of more than 100 elements.

因此，请更新您的R版本和软件包，然后重试。

如何纠正“nullmodel中的错误（comm，方法）：在素食包中找不到函数”list2env“

3 个答案: