使用R的COVID-19数据可视化

时间:2020-05-31 21:27:45

标签: r ggplot2 regression data-visualization

我想利用这段时间来提高R的技能。我选择CoVID-19作为我的主题,并希望可视化一些数据并可能对其进行分析。我会对全球化与流行病之间的联系方式感兴趣(也许通过回归分析)。但是首先,我想可视化一些数据。您有哪些建议对我的目的有用吗? 我已经尝试了一点,但实际上并没有得到任何帮助。 我的想法是一个简单的时间序列图,其中包含Ecdc的累积数据,如今几乎在所有报纸上都可以找到。 作为我使用的数据:

idx_user_status_lookup_2

我已经看过一些教程,并在Stackoverflow中对其进行了研究。到目前为止,我无法输出逻辑图。我的目标是在R中重新创建以下两张图片:

enter image description here enter image description here

1 个答案:

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由于问题似乎主要在于如何开始可视化此数据,因此这就是如何绘制简单的时间序列图,并用ggplot2软件包突出显示一些国家/地区。

库和包导入

library(tidyverse)

data<- read.csv(file= "https://raw.githubusercontent.com/owid/covid-19-data/master/public/data/ecdc/total_cases_per_million.csv")

数据采用所谓的“宽”格式,其中列是日期或地区。 ggplot2对于长数据(每个观察值都是一行)的效果更好。您可以将它们转换如下:

long <- pivot_longer(data, World:Zimbabwe)

接下来,我们需要通过将date列转换为Date类并扔掉NA观察值来清除数据(如果您得到{ {1}}警告,现在可能是人为错误,而不是数据错误。

NA

我们可以选择一些我们要强调的国家。

long$date <- as.Date(long$date)
long <- long[!is.na(long$value),]

然后,我们可以以此绘制线图。有很多关于如何使用ggplot的教程,因此您可以搜索那些以根据特定需求自定义绘图。

highlight_countries <- c("Russia", "San.Marino", "United.States")

reprex package(v0.3.0)于2020-05-31创建