我有一个超堆栈,其中有2个时间帧,每个时间帧有13个z投影。从菜单中,依次选择Process
,Batch
和Macro
。在input
中,选择输入文件夹,然后在output
中确定输出文件夹。最后,我使用下面的代码对所有z投影求和:
run("Z Project...", "projection=[Max Intensity] all");
close();
以下是屏幕截图:
在运行process
或Test
之后,我在输出中得到的文件与输入相同,而z投影未求和。
Here is a sample tif
文件(13 MB)。我尝试在不同的计算机上执行此操作,但结果是相同的。
答案 0 :(得分:0)
我不熟悉以这种方式使用批处理,因此我不确定是否可以直接解决您的问题,但是,我可以说我知道如何通过直接记录/编写宏来做到这一点。但是,首先,您是否尝试过使用截屏的GUI中提供的“保存”按钮?在这种情况下,如果仍然无法正常运行,您可能想在宏编辑器中执行以下操作:
openPath = getDirectory("Choose Source Directory");
savePath = getDirectory("Choose Save Location");
File.makeDirectory(savePath + "UNIQUE ID");
savePath = savePath + "UNIQUE ID" + File.separator;
files = getFileList(openPath);
setBatchMode(true);
for (timePoint = 0; timePoint < (files.length); timePoint++)
{
run("Z Project...", "projection=[Max Intensity] all");
saveAs("Tiff", savePath + "UNIQUE ID");
close();
}
setBatchMode(false);
希望对您有所帮助!