Question

我试图在我的snakemake报告中包含一个（子）报告，该报告是某个目录中的html文件，并且包含同一目录中的各种图像。有没有一种很好的方法可以在标准的蛇形报告中进行这种嵌入？

使用指令：

ObjectOptimisticLockingFailureException

我设法获取snakemake报告中“结果”下列出的html文件。

但是，如果我单击它，我的浏览器（firefox）会问我如何处理该文件，如果我告诉它使用浏览器将其打开，它将打开：

file：///tmp/mozilla_xxx/yyy.html

但是html文件中的相对链接全部断开，并且没有图像显示。

我可以将所有图像直接包含在snakemake报告中，但这似乎适得其反，因为用于生成要嵌入的html的工具已经很好地格式化了所有内容。

Answer 1

一种快速而又肮脏的解决方法是，在您引用图像的任何地方使用os.path.abspath()。假设您可以控制在 somestats.html 中创建的（图像）链接。