R 3.6的arrayQualityMetrics包和GEOquery的来源是什么

Question

每次我尝试在R 3.6中安装新软件包时，都会出现错误，因此我需要知道R 3.6的'arrayQualityMetrics'和'GEOquery'软件包的来源

Answer 1

r的生物包装（例如arrayQualityMetrics包装和GEOquery）的来源是生物导体网站（https://bioconductor.org/）

在r v3.6中安装arrayQualityMetrics软件包：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("arrayQualityMetrics")

在r v3.6中安装G​​EOquery软件包：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("GEOquery")

在r v3.4中安装arrayQualityMetrics软件包：

## try http:// if https:// URLs are not supported
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("arrayQualityMetrics")

在r v3.4中安装G​​EOquery软件包：

## try http:// if https:// URLs are not supported
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("GEOquery")

在以前的版本中安装生物软件包：

解决方案1：在以下链接中选择您的r版本，然后搜索软件包。 install biological package for Previous Releases r

在以前的版本中安装生物软件包：

解决方案2：

setRepositories()
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install.packages("arrayQualityMetrics")
install.packages("GEOquery")