geoQuery并获取CEL文件

Question

即时通讯使用geoQuery包，并希望从GSE下载行CEL文件。

getGEOSuppFiles( "GSE1132" )

如果出现此错误：

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  line 1 did not have 10 elements

对我而言，目前还不清楚如何获取RAW .CEL文件。 我认为GSE id的最佳方法是getGEO，然后处理原始的.CEL文件。

希望有人可以帮助我：P

Answer 1

如果您查看相对链接about the GSE1132，请在页面末尾找到

  

未提供补充数据文件。

因此，当您调用getGEOSuppFiles()函数时，它会失败。

.CEL 文件等原始数据通常以补充数据文件的形式提供。