如何从置信区间字符串中提取数字格式的上下限?

时间:2019-05-27 12:31:16

标签: r

假设一个包含如下置信区间的向量

confint <- c("[0.741 ; 2.233]", "[263.917 ; 402.154]", "[12.788 ; 17.975]", "[0.680 ; 2.450]", "[0.650 ; 1.827]", "[0.719 ; 2.190]")

我希望有两个新矢量,其中一个包含数字格式的下限

lower <- c(0.741, 263.917, 12.788, 0.680, 0.650 , 0.719)

包括其他上限,例如数字格式

upper <- c(2.233, 402.154, 17.975, 2.450, 1.827, 2.190)

6 个答案:

答案 0 :(得分:11)

基本的R解决方案

lower =  as.numeric(sub(".*?(\\d+\\.\\d+).*", "\\1", confint))
upper =  as.numeric(sub(".*\\b(\\d+\\.\\d+).*", "\\1", confint))

lower
[1]   0.741 263.917  12.788   0.680   0.650   0.719
upper
[1] 2.233 402.154  17.975   2.450   1.827   2.190

答案 1 :(得分:2)

mypattern <- '\\[(\\d+\\.\\d+) ; (\\d+\\.\\d+)\\]'
as.numeric(gsub(mypattern, '\\1', confint))
as.numeric(gsub(mypattern, '\\2', confint))

答案 2 :(得分:1)

另一种base R可能性是:

sapply(strsplit(confint, " ; ", fixed = TRUE), function(x) gsub("[^0-9.-]+", "\\1", x) [1])
sapply(strsplit(confint, " ; ", fixed = TRUE), function(x) gsub("[^0-9.-]+", "\\1", x) [2])

[1] "0.741"   "263.917" "12.788"  "0.680"   "0.650"   "0.719"  
[1] "2.233"   "402.154" "17.975"  "2.450"   "1.827"   "2.190" 

如果需要将其用作数字矢量:

sapply(strsplit(confint, " ; ", fixed = TRUE), function(x) as.numeric(gsub("[^0-9.-]+", "\\1", x)) [1])
sapply(strsplit(confint, " ; ", fixed = TRUE), function(x) as.numeric(gsub("[^0-9.-]+", "\\1", x)) [2])

答案 3 :(得分:1)

同时,我想出了另一个base R解决方案

lower <- as.numeric(sub(".]*", "", sub(";.*", "", confint)))
upper <- as.numeric(sub("].*", "", sub(".*;", "", confint)))

lower
[1]   0.741 263.917  12.788   0.680   0.650   0.719
upper
[1]   2.233 402.154  17.975   2.450   1.827   2.190

谢谢大家!

答案 4 :(得分:0)

您可以使用 stringr 库中的功能。

您可以根据特定字符(在您的情况下为str_split())用;分割字符串,然后用str_remove()(在[]中删除字符您的案例),您将获得想要的东西。

str_remove(str_split_fixed(confint, ";", n = 2)[,1], '\\[') %>% as.numeric()
# [1]   0.741 263.917  12.788   0.680   0.650   0.719

答案 5 :(得分:0)

一种tidyverse解决方案:

library(dplyr)
library(tidyr)

df = data.frame(confint)
df = df %>% 
  mutate(confint = gsub("(\\[|\\])","",confint)) %>% 
    separate(confint,c("lower","upper"),";",convert=T)