由于遇到文字点,Snakemake DAG无法正常工作-可能是Graphiz点问题?

时间:2019-05-16 19:09:33

标签: graphviz dot snakemake

我试图使用通过snakemake --dagsnakemake --rulegraph传递给dot的方法,但是由于我认为graphviz无法处理文字点',最终导致出现错误。

我正在Linux的conda环境中使用snakemake 5.4.5。

我最终收到错误消息,并不断说“语法歧义-分隔数严重错误”,我相信这更多的是graphviz问题,而不是snakemake。

snakemake社区中的其他人有没有遇到过这种情况并提出了解决方法?

谢谢。

我碰巧看到这里列出了类似的内容-https://github.com/influxdata/kapacitor/issues/1068

snakemake --forceall --rulegraph | dot -Tpdf > dag.pdf

错误消息

警告:语法不明确-严重分隔数字“ .11”。在拆分的第1行中,分为两个标记 警告:语法有歧义-严重分隔数字'.11'。在拆分的第3行中,分为两个标记 警告:语法有歧义-严重分隔数字'0.13'。在分割成两个标记的第4行中 警告:语法有歧义-严重分隔数字'3.5'。在分割成两个标记的第6行中 正在建立工作的DAG ...

0 个答案:

没有答案