基本R

Question

我正在R基上建立一个简单的热图。 这是我的矩阵：

stleft = matrix( 
     c(0,5,5,2,6,8,4,6,9), 
     nrow=3, 
     ncol=3) 
colnames(stleft) <- c("Narrow","Wide", "Wider")
rownames(stleft) <- c("Person", "Object","Bare")
stleft

矩阵如下：

> stleft
       Narrow Wide Wider
Person      0    2     4
Object      5    6     6
Bare        5    8     9

要构建热图，我只需运行：

heatmap(stleft, Colv = NA, Rowv = NA, scale = "none")

如您所见，“ 0”（对应于窄/人单元格）显示为深红色，而“ 9”（对应于较宽/裸机单元格）显示为浅黄色。

• 如何“翻转”此范围，以使“ 0”以浅色显示，而“ 9”以深色显示？

• 为什么图像被截断？它在RStudio图面板中显示为被截断，并且被保存为截断。我试图将R Studio中的绘图面板放大无济于事。

Answer 1

heatmap()（和image()）默认使用heat.colors()生成颜色。您可以根据需要提供自己的颜色，例如。通过使用heat.colors()，只需反转即可。

par(oma=c(3, 0, 0, 3))
col <- rev(heat.colors(999))
heatmap(stleft, Colv = NA, Rowv = NA, scale = "none", col = col)