Question

我多次尝试使用

从Github下载数据集

> devtools::install_github("crarlus/paprbag")

我在运行R 3.4.4时执行了此操作。该错误包括以下事实：> Biostrings对于该R版本不可用。然后在堆栈溢出中的另一篇文章之后，我安装了新版本R 3.5.3。但是我仍然收到相同的错误消息：

> devtools::install_github("crarlus/paprbag")
Downloading GitHub repo crarlus/paprbag@master
Skipping 1 packages not available: Biostrings
Installing 12 packages: ade4, Biostrings, data.table, doParallel, foreach, iterators, ranger, RcppEigen, segmented, seqinr, stringi, stringr
Installing packages into ‘/home/ibraim/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5’
(as ‘lib’ is unspecified)
Error: (converted from warning) package ‘Biostrings’ is not available (for R version 3.5.3)

您知道如何解决此问题吗？非常感谢。

Answer 1

Biostrings软件包不在CRAN上，而在Bioconductor上。要安装它，您应该使用：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("Biostrings")

错误：Biostrings无法用于R 3.5.3

1 个答案: