如何解决节点不在图中的问题

时间:2019-03-27 13:53:54

标签: python graph networkx

我正在创建一个程序,以从边列表中获取图中节点的邻居,但问题是他向我显示了此错误

A=nx.all_neighbors(G,1)

File"C:\Users\Toshiba\Anaconda2\lib\sitepackages\networkx\classes\function.py", line 838, in all_neighbors  values = graph.neighbors(node)

在邻居中的文件“ C:\ Users \ Toshiba \ Anaconda2 \ lib \ site-packages \ networkx \ classes \ graph.py”,行1130

提高NetworkXError(“节点%s不在图中。”%(n,))

NetworkXError:节点1不在图中。

import networkx as nx
import os


A =os.path.realpath("last_exuction.txt")
fh=open(A, 'rb')
G=nx.read_edgelist(fh)
fh.close()

A=nx.all_neighbors(G,1)

和文件last_exuction.txt的内容

2 1
3 1
3 2
4 1
4 2
4 3
5 1
6 1
7 1
7 5
7 6
8 1
8 2
8 3
8 4
9 1
9 3
10 3
11 1
11 5
11 6
12 1
13 1
13 4
14 1
14 2
14 3
14 4
17 6
17 7
18 1
18 2
20 1
20 2
22 1
22 2
26 24
26 25
28 3
28 24
28 25
29 3
30 24
30 27
31 2
31 9
32 1
32 25
32 26
32 29
33 3
33 9
33 15
33 16
33 19
33 21
33 23
33 24
33 30
33 31
33 32
34 9
34 10
34 14
34 15
34 16
34 19
34 20
34 21
34 23
34 24
34 27
34 28
34 29
34 30
34 31
34 32
34 33

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

节点1不在图中。我怀疑节点'1'是。也就是说,图形中的字符串为'1',而不是整数1

这是因为当您读入文件时,它将所有内容解释为字符串。 documentation显示可选参数:read_edgelist(path, comments='#', delimiter=None, create_using=None, nodetype=None, data=True, edgetype=None, encoding='utf-8')。注意可选参数nodetype。该文档说:

  

nodetype(int,float,str,Python类型,可选)–转换节点数据   从字符串到指定类型

您的通话方式也是

G=nx.read_edgelist(fh, nodetype = int)