我正在阅读一篇论文，作者使用神经网络来产生发射和跃迁概率。我对他们在第4.1节“产生概率”中描述其排放体系结构和过渡体系结构的方式感到困惑。
https://arxiv.org/pdf/1609.09007.pdf
例如，如果我有一个蛋白质序列，该序列可以由20个不同的字母组成，并且该序列中的每个字母都具有基本状态。共有三个基础状态（S，B，C）。那么对于发射架构，我的标记向量（v_i）会是什么样，向量嵌入（w_i）会是什么样？如果有人可以就这个生物学问题进行解释，我将不胜感激，因为这样我会更容易理解。