我正在尝试用输入输出体系结构实现隐马尔可夫模型,但是我找不到相同的任何良好的python实现。
任何人都可以共享Python程序包吗,可以考虑对HMM使用以下实现。
允许连续排放。 允许使用协变量的功能(即I / O HMM中的自变量)。
此刻,我正在努力寻找相同的python实现。
我在hmmlearn中找不到相关示例。
这里是我测试过的一些库:
hmmlearn:hmmlearn允许将多个功能传递给发射/观测,但不提供支持包含协变量(即自变量)的功能。
hmms:不支持添加连续发射的功能,也不支持添加自变量。
IOHMM:我可以使用此库训练HMM模型,但在训练模型后找不到用于做出预测的文档。
因此,我正在寻找符合目的的软件包。
from IOHMM import UnSupervisedIOHMM
from IOHMM import OLS, DiscreteMNL, CrossEntropyMNL, forward_backward
SHMM = UnSupervisedIOHMM(num_states=3, max_EM_iter=200, EM_tol=1e-6)
SHMM.set_models(model_emissions = [OLS(est_stderr=True)],
model_transition=CrossEntropyMNL(solver='lbfgs'),
model_initial=CrossEntropyMNL(solver='lbfgs'))
SHMM.set_inputs(covariates_initial = [], covariates_transition = [], covariates_emissions = [['Insulin']])
SHMM.set_outputs([['Glucose']])
SHMM.set_data([data])
SHMM.train()
经过上述训练,我不知道如何获得发射概率和隐藏状态的顺序。