iNEXT警告消息：在sqrt（var_obs）中：产生了NaN

Question

我收到警告消息：

  

在sqrt（var_obs）中：产生了NaN

在r中运行iNEXT代码out.raw <- iNEXT(pwa, datatype="incidence_raw", endpoint = 125)之后。当我为另一个数据集运行相同的代码时，它工作正常，没有任何错误。任何想法为什么会发生？我应该忽略此警告吗？

我的数据类型是idence_raw（例如，参见数据-纤毛虫）。我使用的是csv。文件和以下代码：pw1 <- as.matrix(apply(pw[,-1],2,as.integer))，row.names(mpw) <- pw[,1]，pa1 <- as.matrix(apply(pa[,-1],2,as.integer))，row.names(mpa) <- pa[,1]，pwa = list(PW = pw1, PA = pa1)，out.raw <- iNEXT(pwa, datatype="incidence_raw", endpoint = 125)。谢谢您的帮助！

Answer 1

此警告表明var_obs中包含负值或非数字值。要查看var_obs的计算方式，请查看源代码：https://github.com/JohnsonHsieh/iNEXT/blob/3b53e0b1818d1086b86fc59cfe793a545d4a11eb/R/EstIndex.R。

我想您的原始数据是问题的根源。