如何在.vmdrc中为VMD

Question

我正尝试在加载时设置默认表示，并且当前已将以下内容添加到默认.vmdrc文件中。

display depthcue off
color Display Background white
display projection orthographic
mol default color {index}
mol default style {CPK 1.0 12 0.3 12}
mol default selection {all}
menu main move 62 1236
menu graphics move 166 1477

我也尝试过这一行：

mol default style CPK

以及选择命令的各种变化，例如{name A}，因为我使用的是hoomd和A类型粒子，但无济于事，无论我做什么，它都会忽略表示样式和颜色设置，但是其他设置也可以。任何人都可以帮助我找出原因吗？谢谢。

Answer 1

这是因为在启动时（在读取.vmdrc文件时）该分子未读入vmd。我怀疑您是从命令行使用“ vmd Molecular.file”启动vmd的，而不是先打开vmd，然后从“文件”>“新分子”选项卡中加载分子。如果以以前的方式进行操作，则.vmdrc文件中的“ mol”指令将应用于不存在的分子。后者应该可以使用您提供的命令。

请参见here，了解如何在命令行启动时使这些默认设置为您工作。