Question

我想在matlab的循环中使用spm_select来选择多个nifti文件。但是，似乎循环无法正确运行。


在每个主题文件夹中（subjList = {'2'，'3'，'6'，...}中总共18个主题，每个主题文件夹中有4个运行（在runList = {'run1'中，'run2'，'run3'，'run4'}。在每次运行中，有254个nitfi文件可供选择。spm_select的使用类似于：

tmp = spm_select('expand',fullfile(SCAN_dir, 'SCAN.nii'));
tmp = cellstr(tmp(6:180,:));

当我的代码如下时

if preprocess == 1
disp('------Preprocessing started------');
for subj = subjList
    disp(strcat('Subject:   ',subj));
    clear matlabbatch;
    cd(dataDir);
    cd(char(strcat(dataDir,subj)));        
    files = {};
    funFiles = {};
    filename = {};
    func = {};
    for i = 1: length(runList)

        files{i} = char(strcat(dataDir,subj,'/',runList{i}));
        filename{i} = dir(fullfile(files{i}, '*.nii'));
        funFiles{i} = strcat(filename{i}.folder,'/',filename{i}.name);
        %read multiple nii files 
         func{i} = spm_select('expand',funFiles{i});
         func{i} = cellstr(func{i}(1:254,:));       
    end; 
    funFiles = funFiles';
    func = func';
    preprocessing_job(funFiles);
end; 
disp('------Preprocessing ended------');
end;

当脚本在spm_select句子之前运行时，一切都很好。但是，当完全运行这部分代码时，会出现以下错误：


使用read_hdr时出错（第36行）


读取头文件“ /”时出错。


nifti错误（第26行）


vol = read_hdr（fname）;


错误spm_select> spm_select_get_nbframes（第268行）


N = nifti（文件）;


错误spm_select> spm_select_expand（第254行）


n = spm_select_get_nbframes（ifiles {i}）;


错误spm_select（第130行）


varargout {1} = spm_select_expand（varargin {2}）;


错误main_analysis_script（第40行）


func {i} = spm_select（'expand'，funFiles {i}）;

我想知道有关“ read_hdr”的第一个错误的原因。头文件有问题吗？该功能文件为4D nifti格式。尽管我对SPM软件包了解更多，但我还是matlab的新手。我正在使用SPM12和MatlabR2018b。有人可以帮我循环或SPM句子吗？非常感谢，等待您的留言。

如何使用spm_select在matlab中读取多个nifti文件？

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