多层边界单元ImageJ宏

时间:2018-11-01 08:45:17

标签: image-processing macros image-segmentation imagej

我有几种显示两层细胞壁的细胞类型的图像,我想评估每个细胞的总面积(细胞大小),并评估没有细胞壁的面积(内腔)。细胞共享细胞壁的外部(raw image 16bits)。

从阈值步骤开始,我获得了带有细胞壁的二进制图像(外部和内部,threshold image),但是由于这些细胞壁的具体解剖结构,可用的插件(通常是为荧光图像开发的)没有以及通常的分段或骨架化步骤。

现在,我正在尝试开发自己的宏,但被阻止了。选择外部单元壁结构时,无法成功将选择转换为多边形或折线。你有一些技巧吗?

第二,如何将内部细胞壁分隔的标签标记为外部细胞壁分隔的对象的一部分? (我不知道问题是否明确)

谢谢。

0 个答案:

没有答案