如何使用scipy gaussian_kde获得概率密度函数？

Question

我有一个1D数据集，保存在1D列表中。获得概率密度函数的最佳方法是什么？我尝试了使用scipy gaussian_kde的常用方法。

array = np.array(values)
kde = gaussian_kde(array)
x = np.linspace(0, 50, 500)
plt.plot(x, kde(x), label="", color="blue")
plt.legend(loc='best')
plt.show()

生成的图不是预期的概率密度函数，因为对于每个x，概率密度函数应具有介于0和1之间的值。

谢谢

Answer 1

使用以下代码。

import os
import matplotlib.pyplot as plt
import sys
import math
import numpy as np
import scipy.stats as st
from scipy.stats._continuous_distns import _distn_names
from scipy.optimize import curve_fit

def get_pdf(latency_list):
    np_array = np.array(latency_list)  # convert the list into a numpy array
    ag = st.gaussian_kde(np_array)  # calculate the kernel density function for the latency values
    # list of equidistant values in the range of the latency values
    x = np.linspace(min(latency_list), max(latency_list), (max(latency_list) - min(latency_list)) * 10)
    y = ag(x)  # evaluate the latency values for each x value
    return x, y