编辑27-07-2018：包装器不占线程数量。此外，我在这里尝试的语法无法正常工作，而且据我所知，不支持类似的语法。答案来自下面Snakemake Google网上论坛和meono上的交叉发布。
我正在使用Snakemake，对此我感到非常满意。但是，对于某些过程，我使用包装器（即FastQC和Trimmomatic）。但是，我注意到这些包装器没有考虑{threads}变量。有人可以解释使这项工作正确的语法是什么吗？
我尝试设置threads: 4，然后在代码的正确位置指定{threads}（例如，对于FastQC：params: "--threads {threads}"）。同样，我已经测试了设置{wildcards.threads}和{snakemake.threads}的设置。看来包装器代码块无法“看到”线程变量的值。
请参见下面的示例。
注意：我查看了Bitbucket snakemake-wrapper存储库和readthedocs自述文件，但找不到答案。
rule FastQC_preTrim:
input:
join(RAW_DATA, PATTERN_ANY)
output:
html="FastQC_pretrim/{sample}.html",
zip="FastQC_pretrim/{sample}_fastqc.zip"
threads: 4
params:
"--threads {wildcards.threads}" # Also tried {threads}
wrapper:
"0.20.1/bio/fastqc"