R / DESeq

时间:2018-04-24 17:14:42

标签: r

我试图找到运行DESeq后生成的基因名称明显不同的基因,我运行以下代码:

results(dds1and2, contrast = c("Time","A0","G0"))
length(which(resA0vsG0$padj < 0.01))

rownames(results[which(resA0vsG0$padj < 0.01), ])

但是我收到以下错误:

  

结果出错[(resA0vsG0 $ padj&lt; 0.01),]:     'closure'类型的对象不是可子集化的

有没有其他方法可以找到哪些基因不同的名称? DESeq生成一组值而不是我无法查看数据的数据集

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