与ade4的典型相关分析

Question

在R的ade4包中是否弃用了cca函数？

library(ade4)
cca(mammals, environment)

输出

could not find function "cca"

我找不到关于此错误的任何文档。

Answer 1

cca软件包版本1.7-10中没有ade4函数。但是，您可以使用基座cancor中的R，如下所示

pop <- LifeCycleSavings[, 2:3]
oec <- LifeCycleSavings[, -(2:3)]
cancor(pop, oec)

<强>被修改

使用以下代码安装版本1.7-4

library(devtools)
install_version("ade4", version = "1.7-4", repos = "http://cran.us.r-project.org")

然后运行

library(ade4)

Answer 2

可能不适用于最新版本的软件包。不过，建议使用cca{vegan}，它来自vegan库。