可变正向选择与素食主义者的部分排序

Question

是否有办法使用包裹素食主义者的函数ordistep对部分规范排序（冗余分析或对应分析）执行变量减少？我检查了Borcard等人。 （2011）数字生态与R和我找不到答案。 我尝试了以下语法，它返回了下一个错误：

Error in formula.default(prda1) : invalid formula

prda1 <- rda(spp.h, env.partial, avu.rda)

rda.ordistep <- ordistep(rda(spp ~ 1, data = env), 
scope = formula(partial.rda), 
direction= "forward", 
pstep=10000, 
trace = FALSE)

Answer 1

如果您在ordistep中进行部分排序，则必须在较低范围内使用部分字词。以下示例适用于素食主义者

中的data(dune, dune.env)

require(vegan)
data(dune, dune.env)
m0 <- rda(dune ~ Condition(Management), dune.env)
m1 <- rda(dune ~ Condition(Management) + ., dune.env)
m <- ordistep(m0, scope = list(lower=m0, upper=m1))

如果您在较低范围内没有Condition(Management)，则会将其视为任何其他变量并考虑删除，或者如果起始模型没有Condition(Management)，则将其视为任何其他变量候选人，但永远不能添加。