在R中使用kknn
包并交叉验证时,是否可以从mlr
模型中检索距离矩阵?
library("mlr")
data(iris)
task = makeClassifTask(data = iris, target = "Species")
lnr = makeLearner(
cl = "classif.kknn",
predict.type = "prob",
k = 5,
kernel = "gaussian",
scale = TRUE
)
cv = crossval(
learner = lnr,
task = task,
iters = 4,
stratify = TRUE,
measures = acc,
show.info = FALSE,
model = TRUE
)
str(cv$models[1])
我在cv$models
或cv$pred
中找不到任何相关内容。
答案 0 :(得分:1)
crossval
的返回值是ResampleResult
,其中包含$models
成员中各个迭代中拟合的模型(请注意,这是一个列表)。模型是底层学习者返回的对象,因此在每个模型中都应该有一个包含距离矩阵的成员$D$
。
有关详细信息,请参阅the tutorial。
编辑:在这种特殊情况下,您不会在通常的位置获得学习者模型,因为kknn
是一个(无模型)聚类器,而kknn
函数实际上并未被调用在mlr
之前predict
。 train
返回的“模型”只是训练数据(有一些额外的位)。
predict
函数只返回预测而不返回模型,所以遗憾的是,在这种特殊情况下,您无法直接到达距离矩阵。但是,您可以从mlr
获取学习者模型并在其上调用kknn
来获取距离矩阵:
kknn(getTaskFormula(cv$models[[1]]$task.desc),
train = cv$models[[1]]$learner.model$data,
test = iris)$D