我无法弄清楚如何记录包装器执行的命令。两个＆＃34; snakemake -p＆＃34;和＆＃34; snakemake -D＆＃34;没有向我显示运行的实际命令。
记录通过包装器创建的命令的最佳方法是什么？
干杯， SEB
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因此，目前，-p确实没有传播到脚本或包装器。但是，我刚刚在代码中更改了它，即将推出的4.0版本将为您提供snakemake -p所需的内容。
请注意，包装器通常不仅仅执行单个shell命令。您可以在包装器描述中的相应页面上找到包装器的完整源代码。例如，请参阅此处 bwa mem ：https://snakemake-wrappers.readthedocs.io/en/stable/wrappers/bwa/mem.html#code