pygit2似乎为repo.status（）返回错误的标志

Question

我正在使用repo.status().items()标志（-a）在预提交挂钩中运行git commit -a -m "Test"，我得到的结果如下：

[('config/git_hooks/pre-commit', 256), ('bin/run_flake8', 256)]

如果我在同一个过程中运行git status，我会得到：

On branch ops_1331_fix
Your branch is ahead of 'origin/ops_1331_fix' by 2 commits.
  (use "git push" to publish your local commits)
Changes to be committed:
  (use "git reset HEAD <file>..." to unstage)

    modified:   bin/run_flake8
    modified:   config/git_hooks/pre-commit

换句话说，pygit2报告这些文件没有上传，git报告他们正在上演。

我不清楚这是libgit2还是pygit2的问题。我已经尝试过挖掘源代码了，但是它很复杂。为什么会出现这种差异？