在R(WRS2包)中使用Wilcox强大ANOVA进行计划对比

时间:2016-11-18 15:36:31

标签: r anova two-way

我使用WRS2在我的数据集上运行双向ANOVA和posthoc测试。然而在对比中,我找不到我需要的比较。是否可以规划自己的对比?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

不幸的是,看起来对比在mcp2atm函数中是硬编码的。一些来自该函数内容的摘录(您可以在命令提示符下键入mcp2atm看到:您还可以dump()将函数添加到外部文件中。

...
temp <- con2way(J, K)
conA <- temp$conA
conB <- temp$conB
conAB <- temp$conAB
if (!op) {  ## note: op is hardcoded to FALSE earlier in the function
    Factor.A <- lincon1(x, con = conA, tr = tr, alpha = alpha)
    Factor.B <- lincon1(x, con = conB, tr = tr, alpha = alpha)
    Factor.AB <- lincon1(x, con = conAB, tr = tr, alpha = alpha)
}
## ... stuff for generating contrast names ...
contrasts <- as.data.frame(cbind(conA, conB, conAB))
colnames(contrasts) <- c(dnamesA, dnamesB, dnamesAB)
rownames(contrasts) <- colnames(dataWide)
...

con2waylincon1是内部WRS2函数(您可以使用WRS2::con2wayWRS2:::lincon1查看它们)。 (如果你真的想深入研究源代码,下载源代码包并解压缩它可能是有意义的。)

要进行自定义对比,您可能需要与WRS2maintainer("WRS2")的维护者一起讨论,或者可能尝试issues tracker on R-forge ...)我不知道是否任何其他强大的统计机制(见robust stats task view)将提供替代路线......