我正在寻找算法或库。我不想让你写我的代码。
我有遗传SNP信息的csv文件。它采用以下格式:
marker, variety1, variety2, variety3
m1, AA, AA,AG
m2, TT, TT, TT
m3, GG, GG, GG
...
我使用汉明距离计算了距离矩阵。
variety1, variety2, variety3,
variety1, 0, n, n
variety2, n, 0, n
variety3, n, n, 0
其中n
是列和行中每个品种的汉明距离。
这是我需要绘制树状图的矩阵吗?
怎么做?