scipy eigh给出正半定矩阵

时间:2016-04-24 05:46:25

标签: python numpy scipy precision eigenvalue

我对scipy的eigh函数存在一些问题,这些函数返回正半定矩阵的负特征值。以下是MWE。

hess_R函数返回一个正半定矩阵(它是秩1矩阵和对角矩阵的总和,两者都带有非负条目)。

import numpy as np
from scipy import linalg as LA

def hess_R(x):
    d = len(x)
    H = np.ones(d*d).reshape(d,d) / (1 - np.sum(x))**2
    H = H + np.diag(1 / (x**2))
    return H.astype(np.float64)

x = np.array([  9.98510710e-02 ,  9.00148922e-01 ,  4.41547488e-10])
H = hess_R(x)
w,v = LA.eigh(H)
print w

打印的特征值是

[ -6.74055241e-271   4.62855397e+016   5.15260753e+018]

如果我在np.float64的返回语句中将np.float32替换为hess_R,我会

[ -5.42905303e+10   4.62854925e+16   5.15260506e+18]

相反,所以我猜这是某种精确问题。

有没有办法解决这个问题?从技术上讲,我不需要使用eigh,但我认为这是我的其他错误的根本问题(取这些矩阵的平方根,得到NaN等)。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我认为问题在于你已经达到了浮点精度的极限。对于线性代数结果来说,一个很好的经验法则是它们对于float32来说大约是10 ^ 8中的一个部分,对于浮动64来说它们在10 ^ 16中大约是一个部分。看起来你的最小到最大的比例。这里的特征值小于10 ^ -16。因此,返回的值实际上不可信,并且取决于您使用的特征值实现的细节。

例如,这里有四种不同的求解器;看看他们的结果:

# using the 64-bit version
for impl in [np.linalg.eig, np.linalg.eigh, LA.eig, LA.eigh]:
    w, v = impl(H)
    print(np.sort(w))
    reconstructed = np.dot(v * w, v.conj().T)
    print("Allclose:", np.allclose(reconstructed, H), '\n')

输出:

[ -3.01441754e+02   4.62855397e+16   5.15260753e+18]
Allclose: True 

[  3.66099625e+02   4.62855397e+16   5.15260753e+18]
Allclose: True 

[ -3.01441754e+02+0.j   4.62855397e+16+0.j   5.15260753e+18+0.j]
Allclose: True 

[  3.83999999e+02   4.62855397e+16   5.15260753e+18]
Allclose: True 

请注意,他们都同意较大的两个特征值,但最小特征值的值从实现变为实现。尽管如此,在所有四种情况下,输入矩阵都可以重建为64位精度:这意味着算法按预期运行,直到达到它们可用的精度。