在R中,我需要将具有两个隐藏状态的HMM拟合到一组序列中。有两个类,每个类都有一组序列。我需要找出某个测试序列来自哪个类,以及隐藏的状态序列是什么。以下是类的子集:
Class 1
QCQRPCWQVFYMWSMSLKEC
CHHVHHVIWYSMEPIWLGIY
HQGYGCSIKYGMYCDLYQLG
CTISQVDCAYPQGDLCGVCQ
QDGDGVWIMGKDMYISCYCK
Class 2
SESQQYWLAEPCEHGWWQCP
QNYSGMLVGWCHTQLSLQIF
QDGYLWWNALPHEDLSGFCQ
QCGGYNHNAEIHEKLSIWDF
GFGKMVWNPGPWESDSLDCF
Test sequence
YYCDGCWIAYHDQDLLVCCV
我尝试过使用HMM软件包但我在Rstudio中不断出现下标错误。