如何从R中的文件导入外部相关矩阵?

时间:2015-10-26 20:58:15

标签: r matrix correlation read.table data-import

我想要导入一个6x6的相关矩阵:

 1.0000
 0.6008   1.0000
 0.4984   0.4749   1.0000
 0.1920   0.2196   0.2079   1.0000
 0.1959   0.1912   0.2010   0.4334   1.0000
 0.3466   0.2979   0.2445   0.3197   0.4207   1.0000

我已尝试直接使用scan(),但不会输入矩阵。

A <- matrix(scan("data.txt", n = 6*6), 6, 6, byrow = TRUE)

这不起作用,因为“数据长度[21]不是行数的子数倍或倍数[6]”。

可以使用哪些其他方法导入外部预先存在的相关矩阵?

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

您确实可以单独使用count.fieldsread.tablesee here),但我认为最合适的解决方案是使用{{1}制作xpnd的对称矩阵(UD中没有MCMCpack)。

NA

给你

max_col <- max( count.fields("data.txt", sep = " ") ) # Insert \t if tab-separated 

library(MCMCpack)
A <- read.table("text.txt", sep=" ", fill=TRUE, col.names=1:max_col)
corr <- xpnd( A[lower.tri(A, diag=T)] , max_col)